LIES 1. Patrones y procesos evolutivos que producen la diversidad.
En esta línea de investigación se abordan por un lado el estudio de los procesos ecológico-históricos que determinan la diversidad a través de estudios sistemáticos de diferentes grupos biológicos y por otro lado la manifestación de los patrones geográficos de diversidad a través de estudios biogeográficos.
LIES 2. Funcionamiento de las poblaciones, comunidades y ecosistemas.
En esta línea de investigación se aborda el estudio de las poblacionales a través de aproximaciones de ecología-evolutiva y por otro lado el estudio de la estructura y función de las comunidades.
LIES 3. Diversidad, conservación y aprovechamiento de Talófitas.
En esta línea de generación del conocimiento se realizan proyectos encaminados al estudio de las algas y los hongos en áreas naturales protegidas y prioritarias para la conservación; además se ha incrementando desarrollo en el aprovechamiento y gestión sostenible de los recursos naturales para la conservación de los ecosistemas en peligro de extinción.
LIES 4. Diagnóstico ambiental y caracterización de la integridad biológica.
En esta línea de investigación se abordan estudios relacionados con bioremediación, integridad biótica y efecto del cambio climático a través de herramientas moleculares, índices de integridad y sistemas de información geográficos.
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